Pop Pop Kitties ist ein Spiel, bei dem Blasen mit einem anthropomorphen Kätzchenmotiv zum Platzen gebracht werden. Wie bei den meisten ähnlichen Spielen benutzt der Spieler einen Shooter, um Gruppen von drei oder mehr Blasen oder Kätzchenköpfen zu erzeugen, um das Spielfeld von allen hängenden Blasen zu befreien. In 110 Levels ist es das Ziel, drei Sterne pro Level zu verdienen, indem man diese Gruppen aus verschiedenen Farben und Katzenrassen zusammenstellt.
Das Spiel bietet dem Spieler einen einfachen Shooter, der mit einer kurzen goldenen Pfeilspitze und einem Kopfprojektil ausgestattet ist. Obwohl eine gepunktete Ziellinie vorhanden ist, muss der Spieler das Spiel dazu auffordern, sie bei Bedarf erscheinen zu lassen. Er zielt mit der Pfeilspitze oder der Ziellinie auf eine Gruppe von zwei oder mehr verbundenen Köpfen, die zum Projektil passen, und schießt dann.
Der Spieler beginnt das Spiel mit drei Sternen auf einer Zeitleiste im unteren rechten Bereich, die schnell abnimmt. Er muss die Kätzchen-Projektilköpfe schnell abschießen, um den Verlust von Sternen zu verhindern. Wenn sie genau zielen und schießen, erscheinen die Köpfe in Lichtblitzen.
Pop Pop Kitties bietet dem Spieler einen Booster, der wie eine Bombe wirkt. Er erscheint als leuchtender, runder Stern, wenn der Spieler genügend Kopfblasen zerplatzen lässt.