Pool Bubbles is een bubbelschietspel met een biljartthema. Het heeft een klassieke groene biljarttafel met een biljartkeu als richtpijl voor de schutter. De speler schiet snoepkleurige projectielen op rijen met dezelfde bubbels op de tafel. Als ze een cluster van drie of meer van deze bubbels maken, krimpt het spel en worden de stukken verwijderd. Het doel van de speler is om de hele tafel leeg te spelen en een fantastische score te behalen om een van de drie kampioensscores te bereiken die aan de rechterkant van het scherm worden weergegeven.
De speler schuift de keu naar links of rechts om een schot te richten. Ze schieten nadat ze de keu hebben uitgelijnd met een bubbel die overeenkomt met het projectiel. Als ze niet-matchende bubbels verwijderen onder een cluster dat verdwijnt, verdwijnen die bubbels ook. De speler krijgt dan een bonus die bij zijn totaalscore wordt opgeteld.
Bij Pool Bubbles mag de speler vijf keer geen bubbels verwijderen voordat er meer stukken aan de pooltafel worden toegevoegd. De speler bevestigt wanneer het spel meer bubbels gaat toevoegen door linksonder te kijken. Als ze geen bubbels kunnen verwijderen met een schot, laat het spel een van de vijf grijze bubbels in dat gebied verdwijnen en laat het een groene, ronde inkeping achter in de tafel.
Het is belangrijk om te weten dat de bubbels rollen als het spel een nieuwe rij op tafel schuift. Veel bubbels in reeds bestaande rijen schuiven naar links of rechts, waardoor nieuwe verbindingspatronen ontstaan.
