Bubble Woods, een bubbelschietspel vergelijkbaar met het populaire Om Nom Bubbles, presenteert de speler een nachtelijke fantasiewereld waarin bosdieren leven in paddenstoelenhuizen die in brand worden gestoken met glow-in-the-dark planten. Een eekhoorn met een sportieve groene klep daagt de speler uit om te proberen kleurrijke clusters van bellen te laten knappen die zijn gemarkeerd met natuurafbeeldingen, zoals vlammen, bladeren, paddestoelhoeden, sterren en waterdruppels, met bijpassende projectielen met behulp van een kanon gemaakt van houtsnijwerk in verschillende delen van het bos.
De speler kan alleen clusters laten knallen die minstens twee bijpassende bubbels en het projectiel bevatten. Ze krijgen 60 seconden om de hoogste score te behalen op een houten plank onder een paarse zandloper met geel zand linksboven in het veld. Uiteindelijk kunnen ze een zandloperbooster verdienen die drie seconden extra aan de klok toevoegt telkens wanneer ze een projectiel op de bel schieten die deze bevat.
Bubble Woods beschikt over een grote verscheidenheid aan deze krachtige boosters. Na verloop van tijd kan de speler ook een regenboogbubbel verdienen die elke bel die is gekoppeld aan de bel waarop hij botst, transformeert zodat deze overeenkomt met het naderende projectiel. Bovendien, wanneer ze 10 opeenvolgende treffers uitvoeren, een streak die wordt gevolgd in het Chain-gebied rechts van de schutter, beloont het spel ze met een vuurbal die ze kunnen afvuren om door veel verschillende bellenclusters te snijden.
De speler verliest als hij de bellenclusters te dicht bij de grond laat glijden.