Papa Panda: Bubble Shooter, een bubbelspel om dieren te redden, laat de speler in elk level patronen van hangende bubbels zoeken naar babydieren die door bubbels worden ingesloten. Om deze baby`s te bevrijden, moet de speler clusters van drie of meer identieke bellen laten knappen rond of met inbegrip van deze bellen of een grote zeshoekige bel die er een gevangen houdt. Tenzij het spel anders aangeeft, hoef je alleen alle bellen met de baby`s te laten knappen om een level te voltooien. Naast de doelen die in de rechterbovenhoek worden weergegeven, zijn er nog andere doelen, zoals het verdienen van punten, het winnen van munten en het verzamelen van drie sterren per level.
Het spel bevat tientallen levels verdeeld over 24 hoofdstukken. De speler gebruikt een gloeiende ringschieter, een gestippelde miklijn en verwisselbare projectielbellen om opdrachten uit te voeren. Ze krijgen ook toegang tot verschillende boosters. Ze kunnen vuurbalbommen afschieten met een cirkelvormige straal van de ontploffingszone en regenboogbubbels met jokers om alle bubbels te raken en te laten knappen. Ze kunnen ook een verlengde miklijn gebruiken met een matte bubbel aan het einde om op een groep bubbels te mikken.
Papa Panda: Bubble Shooter houdt de voortgang van de speler bij via een vulbalk in de linkerbovenhoek. Naarmate de tijd verstrijkt, wordt de speler ook beloond met dagelijkse beloningen, een rad van fortuin en schatkisten. Je kunt bonuspunten, boosters, munten en projectielen ontvangen.