Bubble Shooter Pro oferuje całą zabawę polegającą na strzelaniu do bąbelków, jakiej może sobie życzyć gracz, w stylowym formacie. Gracz kieruje się tymi samymi zasadami, co w przypadku większości strzelanek do bąbelków. Zdobywają najwyższy możliwy wynik, strzelając mieszanką wiszących baniek w kolorze cukierków na gradientowym niebieskim polu z bąbelkami jako pociskami.
Bąbelki pękają tylko wtedy, gdy gracz trafi połączoną parę bąbelków lub więcej, które odpowiadają kolorowi pocisku. Bąbelki oraz wszelkie niepasujące bąbelki poniżej połączonej linii opadają i odbijają się, aż wpadną do strefy punktacji, w której znajdują się kwoty punktów oddzielone krótkimi ściankami (50 | 100 | 250 | 100 | 50). Pęcherzyki czasami odbijają się przez kilka sekund, zanim wpadają w sekcję.
Gracz otrzymuje ciemnoniebieską przerywaną linię celowniczą, która pomaga mu wyrównać strzały, co jest świetną funkcją, biorąc pod uwagę, że może zaistnieć potrzeba odbijania pocisków od bocznych ścian. Otrzymują także ostrzeżenie o kolorze następnego pocisku i maksymalnie pięciu faulach, jakie mogą mieć, zanim gra nałoży karę w postaci dodania nowych bąbelków na boisku.
Bubble Shooter Pro automatycznie uruchamia gracza na poziomie Nowicjusza. Jeśli użyją trzywierszowej zakładki menu hamburgera w lewym dolnym rogu, aby uzyskać dostęp do ekranu konfiguracji, mogą zmienić poziom na Ekspert lub Mistrz.