Bubble Queen Cat is een bubbelspel met een kat-reddingsthema. Tegen een nachtelijke tropische achtergrond met prachtige silhouetten van palmbomen knalt de speler patronen van hangende bellen in clusters van drie of meer bij elkaar horende bellen via een ringschieter. Het doel is om opdrachten uit te voeren, drie met pootafdrukken gemarkeerde gouden sterren per level te verdienen, speciale beloningen uit cadeautjes te verzamelen en katten te redden die vastzitten in bubbels.
De speler knalt clusters uit elkaar door bubbelprojectielen af te schieten met een shooter die twee verwisselbare projectielen heeft en een witgloeiende laserrichtlijn met een projectiel dat qua kleur op elkaar is afgestemd. Het spel helpt de speler door het patroon van bubbels van de onderkant naar de bovenkant van het scherm te schuiven en vervolgens uit het zicht te verdwijnen. De speler kan dit korte laadproces gebruiken om de posities van de bubbels gedeeltelijk of volledig te onthouden om schoten van de schutter nauwkeuriger te maken.
Bubble Queen Cat biedt veel krachtige hulpmiddelen, waaronder patroonbellen die wapens bevatten zoals dynamiet dat bellen wegblaast en bliksemschichten die willekeurig bellen verwijderen. De speler laadt ook boosters onderin het scherm op als hij een bepaald aantal opeenvolgende treffers maakt of een bepaald aantal bubbels laat vallen, waaronder bommen, raketten en energieontploffingen.
De speler moet een level snel uitspelen om de meeste punten en sterren te verdienen. Ze verdienen ook bonuspunten voor elk projectiel dat ze niet gebruiken aan het einde van een level. Het spel beloont ze ook met cadeauboxen en geluksprijzen.