Bubble Queen Cat to gra w puszczanie baniek z motywem ratowania kotów. Na nocnym, tropikalnym tle, które przedstawia oszałamiające sylwetki palm, gracz wyskakuje wzory wiszących bąbelków w klastrach trzech lub więcej pasujących bąbelków za pomocą strzelanki pierścieniowej. Jego celem jest wykonywanie zadań, zdobywanie trzech złotych gwiazdek na każdym poziomie, zbieranie specjalnych nagród z prezentów i ratowanie kotów uwięzionych w bańkach.
Gracz rozbija klastry, strzelając pociskami bąbelkowymi za pomocą strzelanki, która ma dwa wymienne pociski i białą laserową linię celowniczą z konturem dopasowanym do koloru pocisku. Gra pomaga graczowi, przesuwając wzór bąbelków z dołu do góry ekranu, a następnie poza zasięg wzroku. Gracz może wykorzystać ten krótki proces ładowania do częściowego lub całkowitego zapamiętania pozycji bąbelków, aby strzały ze strzelanki były bardziej celne.
Bubble Queen Cat zapewnia wiele potężnych narzędzi, w tym bańki z wzorami, które zawierają broń, taką jak dynamit, który wysadza bańki i błyskawice, które losowo usuwają bańki. Gracz ładuje również dopalacze znajdujące się na dole ekranu, gdy wykona określoną liczbę kolejnych trafień lub upuści określoną liczbę bąbelków, w tym bomby, rakiety i wybuchy energii.
Gracz musi szybko ukończyć poziom, aby zdobyć jak najwięcej punktów i gwiazdek. Zdobywa również punkty bonusowe za każdy pocisk, którego nie użyje do końca poziomu. Gra nagradza ich również skrzynkami z prezentami i nagrodami za szczęśliwy obrót.