Bubble Shooter Vegetables is een bubbelschietspel met ronde groenteschijfjes in plaats van bubbels tegen de achtergrond van een bos overdag. De speler moet in elk level doelen voltooien om het volgende level vrij te spelen. Om een bepaald aantal groenten per soort te verzamelen, moet hij clusters van drie of meer dezelfde groenten maken door op rijen groenten op het speelveld te schieten.
Het spel toont het doel aan de rechterkant. Links wordt het levelnummer en de huidige score weergegeven. Veel voorkomende groenten zijn maïskolven, komkommers, rode kool, rode uien en tomaten. De speler verzamelt zijn doel door met een pijlenschieter op bijpassende groenteschijfjes te schieten terwijl de rijen met willekeurige snelheden over het scherm glijden.
Bubble Shooter Vegetables laat geen bellen knappen. In plaats daarvan krimpen de groenteschijfjes en veranderen ze in een heleboel kleinere schijfjes die vallen en vervagen. Het spel daagt de speler uit door het volgende projectiel niet als voorvertoning te laten zien en door zelfs het type projectiel uit te stellen totdat alle kleinere plakjes van het scherm zijn verdwenen.
Als de speler een doel bereikt, verschijnt er een groene cirkel met een wit vinkje naast het nummer. Ze kunnen een level pas uitspelen als alle doelen een vinkje hebben. Als er een schijf de onderkant van het scherm bereikt, faalt het level. Dat gezegd hebbende, kunnen ze verder gaan met twee rijen verwijderd van het veld door een reclamevideo te bekijken.