Minimal Bubble Shooter is precies wat de titel zegt. Het is een bubbelschietspel met een minimalistisch ontwerp. Dat gezegd hebbende, verwacht het van de speler dat hij dezelfde taak uitvoert als elke andere bubble shooter. Ze moeten bellen van het speelveld verwijderen door groepen van drie of meer identieke bellen met bijpassende projectielen te maken.
Tegen een rijke paarse achtergrond laat het spel een smal, rechthoekig roze kader zien dat dient als rand van het speelveld. De bubbels die aan de bovenkant van het frame hangen, lijken meer op rafelige verfvlekken dan op bubbels. Veel van de afbeeldingen in het spel hebben korrelige randen. Naast de rijen toont het spel een enkel, niet op schaal gemaakt projectiel in een shooter met een eenvoudige ruitvormige aanwijzer die is gevormd uit een aan de zijkant gedraaid vierkant.
Als de speler een groep bij elkaar horende bubbels maakt door projectielen op de rijen te schieten, worden de bubbels helder met bij elkaar horende kleuren, breiden ze zich uit tot buiten de oorspronkelijke bubbelgrootte en overlappen ze elkaar als rimpelingen in het water. De speler krijgt standaardpunten in het midden bovenaan het scherm in de vorm van pixels voor elke cluster en bonuspunten voor elke extra cluster die in een lawine valt.
Minimal Bubble Shooter heeft ook een horizontale stippellijn vlakbij de schutter. Als de speler de bubbels over het veld laat glijden en deze lijn raakt, verliest hij en moet hij opnieuw beginnen.
