Minimal Bubble Shooter jest dokładnie tym, na co wskazuje tytuł. To gra polegająca na strzelaniu do baniek o minimalistycznym wyglądzie. Oczekuje ona jednak od gracza wykonania tego samego zadania, którego wymaga każda inna strzelanka. Musi on usuwać bąbelki z pola gry, tworząc grupy trzech lub więcej identycznych bąbelków z pasującymi pociskami.
Na bogatym fioletowym tle gra wyświetla wąską, prostokątną różową ramkę, która służy jako granice pola gry. Bąbelki wiszące na górze ramki wyglądają bardziej jak poszarpane plamy farby niż bąbelki. Większość grafiki w grze ma rozpikselowane krawędzie. Poza rzędami, gra wyświetla pojedynczy, nie w skali pocisk w strzelance z prostym wskaźnikiem w kształcie rombu utworzonym z obróconego na bok kwadratu.
Gdy gracz utworzy grupę pasujących do siebie bąbelków, strzelając pociskami w rzędy, bąbelki pękają, zmieniając się w przezroczyste z dopasowanymi kolorystycznie konturami, rozszerzając się poza pierwotny rozmiar bąbelka, nakładając się na siebie jak fale na wodzie, a następnie pękając i znikając z pola. Gracz otrzymuje standardowe punkty w górnej środkowej części ekranu w pikselowym formacie liczbowym za każdy klaster i dodatkowe punkty za wszelkie dodatkowe, które spadają w lawinie.
Minimal Bubble Shooter ma również poziomą przerywaną linię w pobliżu strzelca. Jeśli gracz pozwoli bąbelkom zsunąć się w dół pola i dotknąć tej linii, przegrywa i musi zacząć od nowa.
