Monsterboom: Bubble Shooter is een fantasie bubble-popping spel. Niet-speler personages Meiling en Arya proberen een boomhut te bouwen voor Arya. De speler moet clusters bellen laten knappen om een magische monsterboom te planten, water te geven en te laten groeien. Daarnaast helpen hun acties hen om energie van de boom te verzamelen, waarmee ze toegang krijgen tot de bubbel-knallende zijspellen en fruit dat ze verzamelen om behulpzame monsters te benaderen, te voeden en te verjongen.
De speler krijgt een ringshooter, twee verwisselbare projectielen en een gestippelde richtpijl. Ze moeten clusters van drie of meer bij elkaar passende kleuren bellen laten knappen om water te verzamelen. Na verloop van tijd krijgen ze boosters en upgrades om het maken van clusters makkelijker te maken. Ze kunnen een booster gebruiken die de pijl langer maakt en er een richtbel aan toevoegt. Ze hebben ook toegang tot een derde verwisselbaar projectiel.
Monsterboom: Bubble Shooter maakt het spel op verschillende manieren moeilijk. De speler kan alleen waterdruppels verzamelen als onderdeel van een cluster. Met waterflacons en boosters moeten ze een extra stap zetten. Deze bubbels vergroten en blokkeren rijen bubbels. De speler moet dan een apart schot uitvoeren met een bijpassend projectiel om te verzamelen.
Het spel beloont de speler echter ruimschoots. Ze krijgen bonussen als ze clusters in streaks laten knappen. Ze krijgen ook veel boosters door neventaken te voltooien, zoals het halen van een bepaalde score.