Bubble Cave ist ein Spiel, bei dem Blasen geplatzt werden und das mehrere einzigartige Spielelemente enthält. In einer unterirdischen Höhle, die wie ein runder Behälter geformt ist, fallen Blasen und andere Objekte automatisch von einem Shooter über dem Kopf auf eine dunkle Metallkugel in der Mitte der Kammer. Das Ziel des Spielers ist es, farbige Kugeln in Gruppen von drei oder mehr zu entfernen, so viele Punkte wie möglich zu sammeln und zu verhindern, dass sich die Kugeln bis zum Shooter oder gegen die Wände der Höhle stapeln.
Der Spieler steuert die Rotation der Metallkugel. Er zieht eine horizontale Metallkette am unteren Rand des Bildschirms nach rechts und links, um die Kugel im bzw. gegen den Uhrzeigersinn zu drehen.
Bubble Cave macht es schwierig, die Kette zu benutzen und die Kugel mit Tropfen auszurichten, um Cluster von Bubble Balls zu erzeugen. Oftmals dreht der Spieler den Ball zu weit nach rechts oder links, was dazu führt, dass ein fallengelassener Ball nicht mit einem farblich passenden Ball verbunden wird. Außerdem lässt das Spiel unbesiegbare Objekte wie große Steine und doppelt getroffene Objekte wie eisbedeckte Blasen fallen.
Abgesehen davon lässt das Spiel auch Booster-Blasen aus dem Shooter fallen, darunter durchsichtige Blasen mit goldenen Sternen, die alle Blasen in Sterne verwandeln, orangefarbene Flammen, die mindestens eine berührte Blase verbrennen, und blaue Energieblitze, die alle Blasen der gleichen Farbe in die Luft jagen. Es gibt auch eine Portalblase. Ein wachsendes Wurmloch, das von ihr erzeugt wird, transportiert einen großen Haufen passender und nicht passender Blasen und anderer Objekte in einen unsichtbaren Raum.
