Microsoft Sudoku est un jeu de puzzle logique de placement de nombres qui fait passer le Sudoku classique au niveau supérieur. Le but du joueur est de remplir des grilles 9x9 avec les nombres 1 à 9 dans le bon ordre sur des lignes horizontales (rangées) de neuf espaces, des lignes verticales (colonnes) et des blocs de sous-grille 3x3 (maisons) sans aucune répétition des nombres.
Microsoft propose au joueur les modes Puzzles classiques et Puzzles irréguliers et les niveaux de difficulté Facile, Moyen, Difficile et Expert. Avec le mode Irregular Puzzles, la principale différence est que le joueur doit empêcher la répétition dans des zones de neuf espaces de forme irrégulière plutôt que dans des sous-grilles 3x3.
Comme pour les autres jeux de Sudoku, celui-ci pré-remplit certains espaces avec des nombres non amovibles. Le joueur tente alors d'insérer les numéros manquants. Le joueur sélectionne un espace vide puis un numéro sur le clavier à l'écran ou au clavier. Ils peuvent utiliser un bouton de notes pour basculer entre l'utilisation de nombres et les notations de placements possibles de nombres.
Microsoft Sudoku propose plusieurs autres fonctionnalités utiles, notamment un outil qui bloque les doublons et un outil qui affiche les réponses incorrectes avec un surlignage rouge. Le joueur peut également changer rapidement de niveau de difficulté et démarrer de nouveaux jeux en utilisant un signe plus (+) en haut de l'écran à côté des détails du mode. Enfin, le jeu propose un bouton d'effacement, un bouton d'indice et un bouton d'annulation.
Lorsque le joueur termine correctement une série, des anneaux bleus clignotent autour des chiffres. Après avoir terminé une grille 9x9, des éclats et des chutes de confettis apparaissent. Le jeu affiche ensuite des statistiques.
