Το Bubble Pop Butterfly είναι ένα παιχνίδι που ανοίγει φούσκες με ένα εκπληκτικό θέμα φαντασίας. Μέσα σε πολλά διαφορετικά σκηνικά ημέρας και νύχτας σε εκατοντάδες επίπεδα, ο παίκτης σκάει φυσαλίδες με πεταλούδες και άλλα σύμβολα για να αφαιρέσει συνδεδεμένα μοτίβα φυσαλίδων. Μπορούν να σκάσουν μόνο συστάδες από τρεις όμοιες φυσαλίδες που σχηματίζονται από τουλάχιστον δύο κρεμαστές φυσαλίδες και ένα όμοιο βλήμα φυσαλίδας. Στόχος τους είναι να απολαύσουν τη χαλαρωτική ατμόσφαιρα και να παίξουν, ενώ παράλληλα προσπαθούν να κερδίσουν υψηλό σκορ και να συλλέξουν αστέρια και άλλες ανταμοιβές.
Ο παίκτης λαμβάνει ένα ring shooter με δύο εναλλάξιμα βλήματα φυσαλίδων και μια ακτίνα λέιζερ στόχευσης που ταιριάζει χρωματικά με μια σαφή φυσαλίδα στόχευσης στο τέλος. Χρησιμοποιεί τη δέσμη για να ευθυγραμμίζει τις άμεσες και γωνιακές βολές, γεγονός που εγγυάται ότι πυροβολεί με ακρίβεια κάθε φορά που χρησιμοποιεί ένα βλήμα. Όταν ένα βλήμα χτυπήσει ένα αρκετά μεγάλο σύμπλεγμα, οι αντίστοιχες φυσαλίδες σκάνε. Οι μη ταιριαστές φυσαλίδες σκάνε όταν πέφτουν στον πάτο της σκηνής.
Το Bubble Pop Butterfly αποκαλύπτει το μοτίβο στον παίκτη καθώς οι φυσαλίδες εμφανίζονται στο πεδίο, γεγονός που μπορεί να βοηθήσει τον παίκτη να δημιουργήσει μια καλά μελετημένη στρατηγική για να πυροβολεί και να σκάει συστάδες φυσαλίδων. Ο παίκτης λαμβάνει επίσης ενισχυτικά που βοηθούν, όπως ένα ενισχυτικό αστραπής που κόβει μια οριζόντια σειρά και ένα ενισχυτικό πυγολαμπίδας που σκάει τυχαία φυσαλίδες.