Bubble Pop Butterfly é um jogo de rebentar bolhas com um tema de fantasia deslumbrante. Contra muitos cenários diurnos e noturnos variados em centenas de níveis, o jogador rebenta bolhas marcadas com borboletas e outros símbolos para remover padrões de bolhas ligadas. Só pode rebentar grupos de três bolhas iguais formados por, pelo menos, duas bolhas suspensas e um projétil de bolhas iguais. O seu objetivo é desfrutar da atmosfera relaxante e jogar enquanto tenta obter uma pontuação elevada e recolher estrelas e outras recompensas.
O jogador recebe um atirador de anéis com dois projécteis de bolhas que podem ser trocados e um feixe de mira laser de cor correspondente com uma bolha de mira clara no final. O jogador utiliza o feixe para alinhar os disparos directos e angulares, o que garante que está a disparar com precisão sempre que utiliza um projétil. Quando um projétil atinge um aglomerado suficientemente grande, as bolhas correspondentes rebentam. As bolhas que não combinam estouram quando caem no fundo da cena.
O Bubble Pop Butterfly revela o padrão ao jogador à medida que as bolhas aparecem no campo, o que pode ajudar o jogador a criar uma estratégia bem pensada para disparar e rebentar aglomerados de bolhas. O jogador também recebe reforços que o ajudam, incluindo um reforço relâmpago que corta uma linha horizontal e um reforço pirilampo que rebenta bolhas aleatoriamente.
