Bubble Town é um jogo de estourar bolhas. Os Borb Bay Borbs precisam da ajuda do jogador para impedir uma invasão de alienígenas chamada Lumps. A única maneira de revidar é usando um canhão transparente para atirar nas cabeças de Borb, nas cabeças de Borbs, Lumps e outros tipos de objetos em forma de bolha em campos de jogo em 50 níveis.
O jogador só pode salvar cabeças de Borb e soltar cabeças de Lump usando cabeças de projéteis para criar conjuntos correspondentes de três ou mais cabeças no campo. Eles recebem ajuda para direcionar os tiros de uma linha de mira a laser. Quando completam um set, as cabeças caem do campo. O jogo coloca cabeças não correspondentes conectadas abaixo do conjunto dentro do tubo transparente que alimenta o canhão. O jogador ganha pontos com seus arremessos. Eles ganham pontos extras quando realizam grandes quedas e usam as paredes para ângulos de tiro.
Os obstáculos no campo incluem águas-vivas e nuvens que cobrem cabeças, Borbs sonolentos, caixotes de madeira e cabeças bloqueadoras de tiros. Bubble Town permite ao jogador trocar duas cabeças para aumentar a chance de sucesso de um tiro. O jogador também pode usar cinco powerups para completar sua tarefa, incluindo Sureshots para mira perfeita, BubbleBubbles que transformam todos os golpes para combinar, Hotfoots que agem como bolas de fogo, Plungers que tiram uma cabeça do campo e a jogam no canhão, e Wilds que sempre faça combinações perfeitas.
Se o jogador ficar sem projéteis, as cabeças deslizam uma linha pelo campo e o tubo do projétil é recarregado. O jogador perde o jogo se as cabeças deslizarem para o fundo do campo.