Bubble Town est un jeu de bulles. Les Borb Bay Borbs ont besoin de l'aide du joueur pour arrêter une invasion extraterrestre appelée les Lumps. La seule façon de riposter est d'utiliser un canon transparent pour tirer des têtes de Borb sur des têtes de Borbs, des Lumps et d'autres types d'objets en forme de bulles sur des terrains de jeu répartis sur 50 niveaux.
Le joueur ne peut sauvegarder que les têtes de Borb et laisser tomber les têtes de Lump en utilisant des têtes de projectile pour créer des ensembles correspondants de trois têtes ou plus sur le terrain. Ils reçoivent de l'aide pour diriger les tirs à partir d'une ligne de visée laser. Lorsqu’ils terminent un set, les têtes tombent du terrain. Le jeu place des têtes non correspondantes connectées sous l'ensemble à l'intérieur du tube transparent qui alimente le canon. Le joueur gagne des points avec ses tirs. Ils en gagnent des supplémentaires lorsqu’ils effectuent de gros largages et utilisent les murs pour incliner les tirs.
Les obstacles sur le terrain comprennent des méduses et des nuages de linceul qui couvrent les têtes, des Borbs endormis, des caisses en bois et des têtes bloquant les tirs. Bubble Town permet au joueur d'échanger deux têtes pour améliorer les chances de réussite d'un tir. Le joueur peut également utiliser cinq bonus pour accomplir sa tâche, notamment des Sureshots pour une visée parfaite, des BubbleBubbles qui transforment tous les coups en conséquence, des Hotfoots qui agissent comme des boules de feu, des Plungers qui prennent une tête du terrain et la laissent tomber dans le canon, et des Wilds qui font toujours des matchs parfaits.
Si le joueur est à court de projectiles, les têtes glissent d'une rangée sur le terrain et le tube du projectile se remplit. Le joueur perd la partie si les têtes glissent vers le bas du terrain.
