Bubble Town Quest est un autre jeu de tir à bulles qui se concentre sur l'invasion extraterrestre Lumps de Borb Bay dans la série Bubble Town. Les Borbs ont besoin de l'aide du joueur pour forcer les Lumps à retourner au vaisseau spatial. La seule façon de les chasser est d’accomplir des tâches de tir à bulles.
Le joueur commence par sélectionner le mode Journey ou Endless. Pendant le mode Journey, ils jouent à des jeux Straight-Up et Ball sélectionnés au hasard à travers les niveaux d'une carte. Avec le jeu Straight-Up, ils effectuent des tirs à bulles de base. Ils tirent sur la tête de Borb sur des rangées de Borbs et de Lumps. Ils retirent les têtes des terrains de jeu en créant des ensembles d'au moins trois têtes assorties. Avec le jeu de balle, ils enlèvent les têtes par séries d'au moins trois, mais les têtes ne sont pas en rangées. Les têtes se collent au centre du terrain et tournent autour du point central. En mode sans fin, le joueur sélectionne l'un ou l'autre type de jeu. Leur objectif est de jouer pour le plus grand nombre de points.
Bubble Town Quest présente de nombreux obstacles rencontrés dans Bubble Town. Par exemple, le joueur doit vaincre les Lumps, les nuages de linceul, les bloqueurs de tir et les Borbs endormis. Ils utilisent également des boosters de mise sous tension. Par exemple, ils peuvent utiliser un booster Sureshot pour donner à la ligne de visée laser une cible en forme de croix ou un Hotfoot pour se frayer un chemin à travers les têtes.