Bubble Town Quest adalah penembak gelembung lain yang berfokus pada invasi alien Lumps ke Teluk Borb dalam seri Bubble Town. Keluarga Borb membutuhkan bantuan pemain untuk memaksa Lumps kembali ke pesawat luar angkasa. Satu-satunya cara mereka bisa mengusirnya adalah dengan menyelesaikan tugas menembak gelembung.
Pemain memulai dengan memilih mode Perjalanan atau Tanpa Akhir. Selama mode Perjalanan, mereka memainkan permainan Lurus dan Bola yang dipilih secara acak melintasi level di peta. Dengan permainan Straight-Up, mereka melakukan penembakan gelembung dasar. Mereka menembak kepala Borb di barisan Borb dan Lumps. Mereka menghilangkan kepala dari lapangan permainan dengan membuat set yang terdiri dari setidaknya tiga kepala yang cocok. Dengan permainan Bola, mereka menghilangkan kepala dalam set yang terdiri dari setidaknya tiga orang, tetapi kepala tidak dalam barisan. Kepala-kepala tersebut saling menempel di tengah lapangan dan berputar mengelilingi titik pusat. Selama mode Tanpa Akhir, pemain memilih salah satu jenis permainan. Tujuan mereka adalah bermain untuk mendapatkan jumlah poin tertinggi.
Bubble Town Quest menampilkan banyak rintangan yang terlihat di Bubble Town. Misalnya, pemain harus mengalahkan Lumps, shroud cloud, shot-blocker, dan Borb yang tertidur. Mereka juga menggunakan penguat power-up. Misalnya, mereka mungkin menggunakan booster Sureshot untuk memberikan garis bidik laser sebagai target garis bidik atau Hotfoot untuk membakar jalur yang menembus kepala.
