Bubble Town Quest is een andere bubble shooter die zich richt op de buitenaardse invasie van Lumps in Borb Bay in de Bubble Town-serie. De Borbs hebben de hulp van de speler nodig om de Lumps te dwingen terug te keren naar het ruimteschip. De enige manier waarop ze ze kunnen verjagen is door bubbelschiettaken uit te voeren.
De speler begint met het selecteren van de Journey- of Endless-modus. Tijdens de Journey-modus spelen ze willekeurig geselecteerde Straight-Up- en Ball-spellen op verschillende niveaus op een kaart. Met Straight-Up spelen ze basisbellenschieten. Ze schieten Borb-hoofden naar rijen Borbs en Lumps. Ze verwijderen de hoofden van speelvelden door sets van minimaal drie bijpassende hoofden te maken. Bij Ball-play verwijderen ze de koppen in sets van minimaal drie, maar de koppen staan niet in rijen. De koppen plakken bij elkaar in het midden van het veld en draaien rond het centrale punt. Tijdens de Endless-modus selecteert de speler een van beide speltypes. Hun doel is om voor het hoogste aantal punten te spelen.
Bubble Town Quest bevat veel van de obstakels die je in Bubble Town tegenkomt. De speler moet bijvoorbeeld Lumps, sluierwolken, shotblockers en slapende Borbs verslaan. Ze gebruiken ook power-upboosters. Ze kunnen bijvoorbeeld een Sureshot-booster gebruiken om de laserrichtlijn een draadkruis te geven of een Hotfoot om een pad door de hoofden te branden.
