Bubble Town Quest é outro jogo de tiro em bolhas que se concentra na invasão alienígena de Lumps em Borb Bay na série Bubble Town. Os Borbs precisam da ajuda do jogador para forçar os Lumps a retornarem à nave. A única maneira de expulsá-los é completando tarefas de atirar bolhas.
O jogador começa selecionando o modo Journey ou Endless. Durante o modo Journey, eles jogam jogos Straight-Up e Ball selecionados aleatoriamente em todos os níveis de um mapa. Com o jogo Straight-Up, eles realizam tiros básicos de bolhas. Eles atiram nas cabeças de Borb em fileiras de Borbs e Lumps. Eles removem as cabeças dos campos de jogo criando conjuntos de pelo menos três cabeças iguais. No jogo com bola, eles removem cabeças em conjuntos de pelo menos três, mas as cabeças não estão em fileiras. As cabeças ficam juntas no centro do campo e giram em torno do ponto central. Durante o modo Endless, o jogador seleciona qualquer tipo de jogo. Seu objetivo é jogar pelo maior número de pontos.
Bubble Town Quest apresenta muitos dos obstáculos vistos em Bubble Town. Por exemplo, o jogador deve derrotar Lumps, nuvens ocultas, bloqueadores de tiros e Borbs adormecidos. Eles também usam boosters de power-up. Por exemplo, eles podem usar um reforço Sureshot para dar à linha de mira do laser um alvo de mira ou um Hotfoot para abrir caminho através das cabeças.