Bubble Bubble é um jogo de rebentar bolhas. Num mundo mágico, o jogador explora 100 locais repletos de diferentes tamanhos e tipos de bolhas. Em algumas regiões, tudo é cor-de-rosa e as bolhas cobrem o chão. À noite, noutro local, as bolhas em caules flutuam em direção ao céu. Ao longo desta exploração, o jogador ajuda uma menina a remover as bolhas penduradas em diferentes padrões nos campos de jogo. Eles usam um canhão de tiro que parece um marcador de desenho de criança.
O jogador tem de ganhar um nível para desbloquear o seguinte. Embora o campo de jogo principal permaneça o mesmo durante todo o jogo, os cenários e até mesmo as horas do dia mudam.
Em cada nível, o jogador recebe um projétil principal e um secundário. Pode trocar estes projécteis para disparar e rebentar aglomerados de bolhas mais rapidamente. Também recebem uma linha de mira de cor clara, pixelizada e pontilhada para tornar os seus disparos mais precisos.
O jogo só permite ao jogador rebentar bolhas em grupos que contenham duas ou mais bolhas pintadas com a mesma cor do projétil. Quando as bolhas estouram, elas explodem e o jogo atribui pontos. Quaisquer bolhas não correspondentes ligadas a um grupo caem no chão, saltam uma vez e rebentam.
O Bubble Bubble tem boosters ligados a grupos que o jogador recolhe e utiliza em qualquer altura de um nível. Os boosters não são cumulativos de nível para nível. Os mais comuns incluem um impulsionador de energia de seta dupla que rebenta uma linha horizontal, um impulsionador de quatro cores que pode rebentar qualquer aglomerado com base na cor e um impulsionador de relâmpago que pode rebentar bolhas em qualquer sítio.
