Bubble Tower 3D est un jeu de bulles qui présente au joueur une tour ou une colonne de temple cylindrique en pierre recouverte partiellement de boules colorées spongieuses marquées de symboles. Le but du joueur est d'obtenir un score élevé en retirant les boules de la colonne.
Le joueur reçoit une balle projectile colorée à la base de la section ouverte de la colonne qui contient le terrain de jeu. Lorsqu'ils interagissent avec l'écran, le jeu fait rouler la balle sur le côté de la colonne. La balle peut coller à une seule balle correspondante ou à une ou plusieurs balles non correspondantes. S'il roule en deux boules identiques ou plus, toutes les boules de la même couleur éclatent et disparaissent.
Le jeu permet au joueur de faire pivoter la tour à gauche et à droite afin qu'il ait plus de chances de faire correspondre et de retirer les balles à chaque tir. S'ils accomplissent cette tâche assez rapidement pendant qu'un nombre multiplicateur clignote à l'écran, ils reçoivent des multiplicateurs toujours plus élevés et des points plus élevés. Cette fonction bonus se réinitialise à chaque fois que le numéro multiplicateur disparaît.
Bubble Tower 3D laisse tomber un nouvel anneau de balles sur la colonne chaque fois que le joueur ne parvient pas à faire un match cinq fois. Il aide le joueur à retirer les balles et à ouvrir des possibilités de match en affichant un aperçu du prochain projectile sur le côté gauche de l'écran au-dessus de cinq balles d'avertissement. Il fournit également au joueur une boule de feu toutes les deux minutes. Ils peuvent utiliser cet outil pour brûler plusieurs boules de différentes couleurs sur tout un côté de la colonne.
