Bubble Tower 3D es un juego de hacer estallar burbujas que presenta al jugador una torre o columna de templo cilíndrica de piedra cubierta parcialmente con bolas blandas de colores marcadas con símbolos. El objetivo del jugador es conseguir una puntuación alta quitando las bolas de la columna.
El jugador recibe una bola proyectil de color en la base de la sección abierta de la columna que contiene el campo de juego. Cuando interactúan con la pantalla, el juego hace rodar la pelota por el costado de la columna. La pelota puede adherirse a una sola pelota que coincida o a una o más pelotas que no coincidan. Si se convierte en dos o más bolas iguales, todas las bolas del mismo color explotan y desaparecen.
El juego le permite al jugador rotar la torre hacia la izquierda y hacia la derecha para que tenga más posibilidades de unir y eliminar bolas con cada tiro. Si realizan esta tarea lo suficientemente rápido mientras un número multiplicador parpadea en la pantalla, recibirán multiplicadores cada vez mayores y puntos más altos. Esta función de bonificación se reinicia cada vez que desaparece el número multiplicador.
Bubble Tower 3D deja caer un nuevo anillo de bolas en la columna cada vez que el jugador no logra hacer una combinación cinco veces. Ayuda al jugador a eliminar bolas y abrir posibilidades de juego mostrando una vista previa del siguiente proyectil en el lado izquierdo de la pantalla, encima de cinco bolas de advertencia. También proporciona al jugador una bola de fuego cada dos minutos. Pueden usar esta herramienta para quemar varias bolas de diferentes colores en todo un lado de la columna.
