Bubble Tower 3D è un gioco scoppiabolle che presenta al giocatore una torre cilindrica o una colonna di un tempio in pietra ricoperta parzialmente da morbide palline colorate contrassegnate da simboli. L'obiettivo del giocatore è guadagnare un punteggio elevato rimuovendo le palline dalla colonna.
Il giocatore riceve una palla colorata alla base della sezione aperta della colonna che contiene il campo di gioco. Quando interagiscono con lo schermo, il gioco fa rotolare la pallina lungo il lato della colonna. La pallina potrebbe attaccarsi a una singola pallina corrispondente o a una o più palline non corrispondenti. Se rotola in due o più palline uguali, tutte le palline dello stesso colore scoppiano e scompaiono.
Il gioco consente al giocatore di ruotare la torre a sinistra e a destra in modo che il giocatore abbia maggiori possibilità di abbinare e rimuovere palline ad ogni tiro. Se eseguono questo compito abbastanza velocemente mentre un numero moltiplicatore lampeggia sullo schermo, ricevono moltiplicatori sempre crescenti e punti più alti. Questa funzione bonus si reimposta ogni volta che il numero del moltiplicatore scompare.
Bubble Tower 3D rilascia un nuovo anello di palline sulla colonna ogni volta che il giocatore non riesce a creare una corrispondenza cinque volte. Aiuta il giocatore a rimuovere le palline e ad aprire possibilità di partita visualizzando un'anteprima del prossimo proiettile sul lato sinistro dello schermo sopra cinque palline di avvertimento. Fornisce inoltre al giocatore una palla di fuoco ogni due minuti. Possono utilizzare questo strumento per bruciare più palline di colori diversi su un intero lato della colonna.
