Το Sea Bubble Shooter είναι ένα παιχνίδι που ανοίγει φούσκες. Σε μια βαθιά, υποβρύχια πόλη, ο παίκτης σκάει φυσαλίδες που εμφανίζονται σε μοτίβα γύρω από ένα εξαγωνικό σχήμα με διακόσμηση αστεριού στο κέντρο του πεδίου παιχνιδιού. Αφαιρεί τις φυσαλίδες πυροβολώντας βλήματα σε δύο ή περισσότερες όμοιες γειτονικές φυσαλίδες. Μπορούν επίσης να καθαρίσουν το πεδίο από φυσαλίδες χτυπώντας το εξάγωνο με ένα μόνο βλήμα.
Όταν ο παίκτης πυροβολεί φυσαλίδες σε ένα μοτίβο γύρω από το εξάγωνο, ολόκληρο το μοτίβο περιστρέφεται. Ο παίκτης μπορεί να χρειαστεί να προβλέψει την κατεύθυνση της περιστροφής. Μπορεί να εκτελέσει πιο ακριβή στόχευση και βολές χρησιμοποιώντας μια ελαστική λευκή γραμμή στόχευσης που τραβάει από την περιοχή βλήματος κάτω από το πεδίο παιχνιδιού σε μια συγκεκριμένη φυσαλίδα ή άλλο σημείο. Μπορούν επίσης να απομακρύνουν γρήγορα τις φυσαλίδες χρησιμοποιώντας τέσσερις ενισχυτές κοντά στην κάτω δεξιά γωνία.
Εάν ο παίκτης αποτύχει να σκάσει φυσαλίδες έναν ορισμένο αριθμό φορών, νέες φυσαλίδες σχηματίζονται και επεκτείνονται σε κενές τυχαίες θέσεις μέσα στο μοτίβο. Χάνει επίσης την ευκαιρία να κερδίσει όλα τα αστέρια επιτευγμάτων που του δίνει το παιχνίδι.
Το Sea Bubble Shooter δίνει και τα τρία αστέρια στον παίκτη μόνο όταν έχει εξαιρετικά καλές επιδόσεις. Τους επιβραβεύει επίσης με νόμισμα. Μόλις αποκτήσουν έναν ορισμένο αριθμό αστεριών, μπορούν να ξεκλειδώσουν νέα περιβάλλοντα του παιχνιδιού. Μπορούν να χρησιμοποιήσουν το συνάλλαγμα για να αγοράσουν επιπλέον ενισχυτές.
