Bubble Shooter Pro 3, treća igra u istoimenoj seriji, nudi puno više elemenata pucanja u mjehuriće od prethodne igre, uključujući postignuća, promjene sučelja i natjecateljsku igru na ploči s najboljim rezultatima. Kao i kod gotovo svih bubble shootera, primarni cilj igrača je zaraditi što više bodova. Kao i kod Pro 2, oni pokušavaju spriječiti da brzoklizeći mjehurići dođu do dna zaslona. Jedna velika razlika u odnosu na Pro 3 je ta što moraju pokušati prestići druge igrače na ljestvici kako bi vidjeli mogu li doći do prve pozicije.
Igra nagrađuje igrača za postignuća, kao što je postizanje određenog broja bodova ili vrijednosti u nizu. Čak dobivaju priznanje za stvaranje određenog broja vatrenih kugli i igranje uzastopnih dana zaredom. Igra zahtijeva da igrač ispali projektilni mjehurić na klizne mjehuriće kako bi napravio mečeve koji rezultiraju s tri ili više mjehurića identične boje koji padaju iz redova i odbijaju se u dijelove područja s bodovnim nagradama. Kada igrač uzastopno ispušta mjehuriće, dobiva množitelje, predstavljene povećanjem nagrada od najmanje 50 bodova tijekom igre bez množitelja do 1000 bodova tijekom neprekinutih nizova.
Bubble Shooter Pro 3 također nagrađuje igrača bombama i vatrenim kuglama. Moraju gledati oglase da bi koristili bombe. Prate svoj napredak na dvobojnoj plavoj vodoravnoj traci s uvijenim prugama u gornjem središnjem dijelu zaslona koja prikazuje smajlić na jednom kraju i poklon na drugom kraju. Igra prikazuje krugove sa slikama drugih igrača koje igrač mora prestići da bi dobio dodatne bodove.
