Bubble Shooter Pro 3, het derde spel in de gelijknamige serie, biedt veel meer bubbelschietelementen dan het vorige spel, inclusief prestaties, interfaceveranderingen en competitief spel op het klassement. Zoals bij bijna alle bubble shooters is het primaire doel van de speler om de meeste punten te verdienen. Net als bij Pro 2 proberen ze te voorkomen dat snelglijdende bubbels de onderkant van het scherm bereiken. Een groot verschil met Pro 3 is dat ze moeten proberen andere spelers op het klassement in te halen om te zien of ze de eerste positie kunnen bereiken.
Het spel beloont de speler voor prestaties, zoals het behalen van een bepaald aantal punten of streak-waarde. Ze krijgen zelfs erkenning voor het maken van een bepaald aantal vuurballen en het spelen van opeenvolgende dagen op rij. Het spel vereist dat de speler een projectielbel op de glijdende bubbels schiet om combinaties te maken die ertoe leiden dat drie of meer identiek gekleurde bubbels uit de rijen vallen en in delen van een puntbeloningsgebied stuiteren. Wanneer de speler achtereenvolgens bubbels laat vallen, ontvangt hij vermenigvuldigers, vertegenwoordigd door een verhoging van de beloningen van minimaal 50 punten tijdens niet-vermenigvuldigerspel tot 1.000 punten tijdens ononderbroken streaks.
Bubble Shooter Pro 3 beloont de speler ook met bommen en vuurballen. Ze moeten advertenties bekijken om de bommen te gebruiken. Ze volgen hun voortgang op een tweekleurige blauwe horizontale balk met gedraaide strepen bovenaan in het midden van het scherm, met aan de ene kant een smiley en aan de andere kant een cadeautje. Het spel toont cirkels met afbeeldingen van andere spelers die de speler moet inhalen om extra punten te ontvangen.
