Bubble Shooter Pro 3, el tercer juego de la serie del mismo nombre, ofrece muchos más elementos de disparar burbujas que el juego anterior, incluidos logros, cambios de interfaz y juego competitivo en la clasificación. Como ocurre con casi todos los tiradores de burbujas, el objetivo principal del jugador es ganar la mayor cantidad de puntos. Al igual que con Pro 2, intentan evitar que las burbujas que se deslizan rápidamente lleguen a la parte inferior de la pantalla. Una diferencia importante con Pro 3 es que deben intentar adelantar a otros jugadores en la clasificación para ver si pueden alcanzar la primera posición.
El juego recompensa al jugador por logros, como alcanzar una cantidad específica de puntos o un valor de racha. Incluso reciben reconocimiento por crear una cantidad específica de bolas de fuego y jugar días consecutivos. El juego requiere que el jugador dispare una burbuja proyectil a las burbujas deslizantes para hacer combinaciones que resulten en tres o más burbujas del mismo color que caen de las filas y rebotan en secciones de un área de recompensa de puntos. Cuando el jugador deja caer burbujas consecutivamente, recibe multiplicadores, representados por un aumento en las recompensas desde un mínimo de 50 puntos durante el juego sin multiplicadores hasta 1000 puntos durante rachas ininterrumpidas.
Bubble Shooter Pro 3 también recompensa al jugador con bombas y bolas de fuego. Deben ver anuncios para usar las bombas. Siguen su progreso en una barra horizontal de dos tonos de azul con rayas retorcidas en la parte superior central de la pantalla que presenta una cara sonriente en un extremo y un regalo en el otro. El juego muestra círculos con imágenes de otros jugadores que el jugador debe superar para recibir puntos adicionales.