Smarty Bubbles 2 agrega nueva dinámica a la divertida serie de hacer estallar burbujas. Introduce un tema submarino con un campo de juego de color azul violáceo y sonidos asociados con burbujas de agua. Al igual que en el original, el jugador usa una flecha helada y proyectiles para ganar puntos al hacer estallar líneas conectadas de burbujas brillantes que parecen dulces.
El juego desafía al jugador haciendo que las burbujas desciendan a un ritmo rápido que se alterna de un nivel a otro y ofreciendo una bonificación de tiempo basada en la cantidad de tiempo que le toma al jugador completar un nivel. También presenta un juego sin fin que hace que el jugador regrese al primer nivel si falla. Se produce una falla cuando las burbujas se deslizan debajo de una línea horizontal con rayas rojas y negras.
Cada vez que el jugador dispara uno de los coloridos proyectiles a juego, el impacto detiene ligeramente el descenso de las filas. Aunque el juego siempre muestra el siguiente proyectil disponible, no ofrece una herramienta de intercambio. Como resultado, el jugador debe usar un proyectil que no coincida para ganar ese segundo extra antes de disparar rápidamente un proyectil coincidente para crear una línea de tres o más burbujas unidas.
Smarty Bubbles 2 presenta una burbuja de color arcoíris marcada con una estrella dorada que el jugador debe golpear para finalizar un nivel y recibir la puntuación más alta. Dicho esto, el jugador no puede recibir la mejor puntuación a menos que borre todas las burbujas antes de golpearlas. Si lo golpean primero, las burbujas restantes caen y rebotan sin que el juego recompense puntos.
