Smarty Bubbles 2 lägger till ny dynamik till den roliga serien med bubblor. Den introducerar ett undervattenstema med ett lilablått spelfält och ljud associerade med vattenbubblor. Som med originalet använder spelaren en frostad pil och projektiler för att tjäna poäng genom att spränga sammankopplade rader av blanka, godisliknande bubblor.
Spelet utmanar spelaren genom att få bubblorna att sjunka i en snabb takt som växlar från nivå till nivå och genom att erbjuda en tidsbonus baserad på hur lång tid det tar för spelaren att slutföra en nivå. Det har också oändligt spel som studsar spelaren tillbaka till den första nivån om de misslyckas. Ett misslyckande uppstår när några bubblor glider under en röd-svart, randig horisontell linje.
Varje gång spelaren skjuter en av de färgglada matchande projektilerna pausar nedslaget nedstigningen av raderna något. Även om spelet alltid visar nästa tillgängliga projektil, erbjuder det inget växlingsverktyg. Som ett resultat måste spelaren använda en icke-matchande projektil för att vinna den där extra sekunden innan de snabbt avfyrar en matchande projektil för att skapa en rad med tre eller flera kopplade bubblor.
Smarty Bubbles 2 introducerar en regnbågsfärgad bubbla märkt med en gyllene stjärna som spelaren måste träffa för att avsluta en nivå och få högsta poäng. Som sagt, spelaren kan inte få den bästa poängen om de inte tar bort varje bubbla innan de träffar den. Om de träffar den först, tappar de återstående bubblorna och studsar iväg utan att spelet ger poäng.
