Smarty Bubbles 2 adiciona novas dinâmicas à divertida série de estourar bolhas. Ele apresenta um tema subaquático com um campo de jogo azul-arroxeado e sons associados a bolhas de água. Tal como acontece com o original, o jogador usa uma flecha fosca e projéteis para ganhar pontos ao estourar linhas conectadas de bolhas brilhantes semelhantes a doces.
O jogo desafia o jogador fazendo as bolhas descerem em um ritmo rápido que alterna de nível para nível e oferecendo um bônus de tempo baseado na quantidade de tempo que o jogador leva para completar um nível. Ele também oferece jogo sem fim que leva o jogador de volta ao primeiro nível se falhar. Uma falha ocorre quando qualquer bolha desliza abaixo de uma linha horizontal listrada vermelha e preta.
Cada vez que o jogador atira um dos projéteis coloridos correspondentes, o impacto interrompe ligeiramente a descida das linhas. Embora o jogo sempre mostre o próximo projétil disponível, ele não oferece ferramenta de troca. Como resultado, o jogador deve usar um projétil diferente para ganhar aquele segundo extra antes de disparar rapidamente um projétil correspondente para criar uma linha de três ou mais bolhas vinculadas anexadas.
Smarty Bubbles 2 apresenta uma bolha da cor do arco-íris marcada com uma estrela dourada que o jogador deve acertar para terminar um nível e receber a pontuação mais alta. Dito isto, o jogador não pode receber a melhor pontuação a menos que elimine todas as bolhas antes de atingi-las. Se acertarem primeiro, as bolhas restantes caem e ricocheteiam sem que o jogo recompense pontos.
