Smarty Bubbles 2 ajoute une nouvelle dynamique à la série amusante de bulles. Il introduit un thème sous-marin avec un terrain de jeu bleu violacé et des sons associés aux bulles d'eau. Comme dans l'original, le joueur utilise une flèche givrée et des projectiles pour gagner des points en faisant éclater des lignes connectées de bulles brillantes ressemblant à des bonbons.
Le jeu met le joueur au défi en faisant descendre les bulles à un rythme rapide qui alterne de niveau en niveau et en offrant un bonus de temps basé sur le temps nécessaire au joueur pour terminer un niveau. Il propose également un jeu sans fin qui ramène le joueur au premier niveau en cas d'échec. Un échec se produit lorsque des bulles glissent sous une ligne horizontale rayée rouge et noire.
Chaque fois que le joueur tire l'un des projectiles colorés correspondants, l'impact interrompt légèrement la descente des rangées. Bien que le jeu affiche toujours le prochain projectile disponible, il ne propose pas d'outil d'échange. En conséquence, le joueur doit utiliser un projectile non correspondant pour gagner cette seconde supplémentaire avant de tirer rapidement un projectile correspondant pour créer une ligne de trois bulles liées ou plus attachées.
Smarty Bubbles 2 introduit une bulle de couleur arc-en-ciel marquée d'une étoile dorée que le joueur doit frapper pour terminer un niveau et recevoir le score le plus élevé. Cela dit, le joueur ne peut pas obtenir le meilleur score à moins d'avoir effacé chaque bulle avant de la toucher. S'ils le frappent en premier, les bulles restantes tombent et rebondissent sans que le jeu ne rapporte de points.
