Om Nom Bubbles présente l'adorable monstre Nommie des jeux Cut the Rope, Om Nom, offrant au joueur une action de tir à bulles avec ses friandises préférées à rayures et tourbillonnantes. Le joueur utilise un canon pour tirer des bonbons durs bleus, verts, rouges, jaunes et d'autres couleurs sur des bonbons liés qui glissent sur l'écran tout en étant suspendus à une structure avec une bannière et des poteaux rayés rouges et blancs. L'action se déroule dans divers lieux du monde, notamment la maison d'Evan Coulton, l'enfant qui s'occupe d'Om Nom, la plage et la forêt.
Le joueur ne peut faire éclater des bonbons que lorsque le projectile correspond à un bonbon sur le terrain qui est lié à au moins un autre bonbon correspondant. Le jeu attribue des points pour chaque match. Le joueur dispose de 60 secondes pour gagner autant de points que possible en utilisant diverses techniques. S'ils terminent une séquence de 10 matchs, ils reçoivent une boule de feu qu'ils peuvent couper et faire éclater une large bande de bulles.
Om Nom charge les bonbons dans le canon. Le joueur peut utiliser ses commandes pour échanger le projectile du canon avec le prochain disponible afin d'améliorer ses chances de faire des matchs consécutifs. Ils peuvent également utiliser une ligne extensible de points de ciblage pour améliorer la précision de leurs tirs.
Om Nom Bubbles récompense le joueur avec des points bonus une fois le temps écoulé. Le joueur peut utiliser ces points pour acheter des boosters, appelés boosts, qui se débloquent une fois que le joueur a terminé autant de niveaux. Les boosters comprennent un sablier qui offre du temps supplémentaire et une boule magique de couleur arc-en-ciel qui change la couleur des bulles liées à toute bulle qu'elle frappe pour la même couleur que le prochain projectile.
