Om Nom Bubbles toont het schattige Nommie-monster uit de Cut the Rope-spellen, Om Nom, en biedt de speler bubbelschietactie met zijn favoriete gestreepte en gewervelde snoepjes. De speler gebruikt een kanon om blauwe, groene, rode, gele en andere kleuren harde snoepjes te schieten op gekoppelde snoepjes die over het scherm glijden terwijl ze aan een structuur hangen met een spandoek en rood-wit gestreepte palen. De actie vindt plaats op verschillende locaties in de wereld, waaronder het huis van Evan Coulton, het kind dat voor Om Nom zorgt, het strand en het bos.
De speler kan alleen snoepjes laten knallen als het projectiel overeenkomt met een snoepje op het veld dat is gekoppeld aan ten minste één ander bijpassend snoepje. Het spel kent punten toe voor elke wedstrijd. De speler krijgt 60 seconden om met behulp van verschillende technieken zoveel mogelijk punten te verdienen. Als ze een reeks van 10 wedstrijden voltooien, ontvangen ze een vuurbal die ze kunnen doorsnijden en een brede strook bubbels kunnen laten knallen.
Om Nom laadt de snoepjes in het kanon. De speler kan de besturing gebruiken om het kanonprojectiel te verwisselen met het volgende beschikbare projectiel om de kansen op opeenvolgende wedstrijden te vergroten. Ze kunnen ook een rekbare lijn van richtpunten gebruiken om de nauwkeurigheid van hun schoten te verbeteren.
Om Nom Bubbles beloont de speler met bonuspunten nadat de tijd om is. De speler kan deze punten gebruiken om boosters te kopen, ook wel boosts genoemd, die worden ontgrendeld nadat de speler zoveel niveaus heeft voltooid. De boosters omvatten een zandloper die voor extra tijd zorgt en een magische regenboogkleurige bal die de kleur van de bubbels die gekoppeld zijn aan elke bel die hij raakt, verandert in dezelfde kleur als het volgende projectiel.