Bubble Fall is een schiet- en knalspel dat het spel in een heel andere richting stuurt dan de meeste bubbelschieters. De speler wacht, in een bijna first-person-shooter-perspectief, op een hangbrug nabij een groen bos. Gekleurde plastic ballen, verdeeld in een breed scala aan patronen, rollen over de brug naar hen toe. De speler schiet gekleurde projectielballen op het patroon om er ballen uit te halen. Wanneer de ballen langs de ringschieter gaan en uit het zicht rollen, knallen ze eindelijk en maken prachtige muziekinstrumentgeluiden.
De speler kan de ballen niet dwingen om uit het patroon los te laten, tenzij ze twee of meer in dezelfde kleur passende ballen raken met een projectiel in dezelfde kleur. Ze laten de meeste ballen los als ze een deel van het patroon raken dat een lijn bellen verbindt die zich dichter bij de bovenkant van het scherm bevindt en het verst verwijderd is van de positie van de schutter en de speler. De game biedt ze een gouden laserrichtlijn om nauwkeurige schoten te garanderen.
Bubble Fall biedt de speler ook boosters, waaronder bommen die opblazen en grote cirkelvormige gebieden met ballen vrijgeven, en raketten die er doorheen snellen en een lange strook ballen vrijgeven. Bovendien kan de speler ballen loslaten door zich te richten op de ballen die zijn gemarkeerd met witte geschenkdozen.
Als de speler herhaaldelijk ballen loslaat, ontvangen deze steeds meer vermenigvuldigde punten. Ze krijgen ook een hoger aantal punten als ze veel ballen tegelijk loslaten.