Smarty Bubbles 2 dodaje novu dinamiku zabavnoj seriji pucanja mjehurića. Predstavlja podvodnu temu s ljubičasto-plavim igralištem i zvukovima povezanim s vodenim mjehurićima. Kao i kod originala, igrač koristi zaleđenu strijelu i projektile kako bi zaradio bodove pucajući povezane linije sjajnih mjehurića poput bombona.
Igra predstavlja izazov igraču tjerajući mjehuriće da se spuštaju brzim tempom koji se izmjenjuje od razine do razine i nudeći vremenski bonus na temelju vremena koje je potrebno igraču da završi razinu. Također nudi beskrajnu igru koja igrača vraća na prvu razinu ako ne uspije. Kvar se događa kada mjehurići skliznu ispod crveno-crne prugaste vodoravne linije.
Svaki put kad igrač ispali jedan od raznobojnih odgovarajućih projektila, udar lagano zaustavlja spuštanje redova. Iako igra uvijek prikazuje sljedeći dostupni projektil, ne nudi alat za zamjenu. Kao rezultat toga, igrač mora koristiti projektil koji se ne podudara kako bi dobio tu dodatnu sekundu prije nego što brzo ispali odgovarajući projektil kako bi stvorio liniju od tri ili više povezanih mjehurića.
Smarty Bubbles 2 uvodi mjehurić duginih boja označen zlatnom zvjezdicom koji igrač mora pogoditi kako bi završio razinu i dobio najveći rezultat. Ipak, igrač ne može dobiti najbolji rezultat osim ako ne očisti svaki balon prije nego što ga pogodi. Ako prvi pogode, preostali mjehurići padaju i odbijaju se bez nagradnih bodova u igri.
