Bouncing Balls adalah permainan menembak gelembung yang menampilkan bola gelembung warna campuran dengan pola spiral yang ditampilkan dalam barisan yang menempel di bagian bawah pelat abu-abu-perak seberat 1.000 ton di dalam mesin cetak. Dengan latar belakang bidang permainan berwarna biru-hitam di dalam mesin cetak, pemain menggunakan penembak cincin dengan penunjuk berbentuk seperti ujung pedang untuk menargetkan dan menembakkan proyektil ke barisan untuk membuat dan menghapus kelompok tiga atau lebih bola yang cocok.
Pelat tekan dan bola bergerak perlahan di layar. Hasilnya, pemain tidak perlu terburu-buru saat mencoba menyelesaikan tugas ini di beberapa level pertama. Mereka hanya perlu menargetkan bola gelembung secara akurat, yang dibuat sulit oleh game ini dengan tidak menyediakan garis bidik. Meskipun begitu, pemain dapat mengarahkan tembakan dari dinding samping untuk mengenai kelompok bola yang saling terhubung dan sulit dijangkau.
Meskipun Bouncing Balls juga tidak menyediakan opsi menukar proyektil, pemain menerima pratinjau proyektil berikutnya untuk membantu mereka merencanakan pukulan lebih cepat. Saat mereka melakukan pukulan yang menciptakan gugusan, bola-bola gelembung tidak benar-benar memantul. Satu-satunya aksi memantul terjadi ketika pemain mengarahkan bidikan ke salah satu dari dua dinding samping. Sebaliknya, bola-bola itu menyusut, berubah menjadi bintang oranye, dan kemudian menghilang dari lapangan.