Bouncing Balls to gra polegająca na strzelaniu do bąbelków, w której bąbelkowe kulki o mieszanych kolorach ze spiralnymi wzorami są wyświetlane w rzędach przymocowanych do spodu 1000-tonowej szaro-srebrnej płyty wewnątrz prasy. Na tle gradientowego niebiesko-czarnego pola gry wewnątrz obudowy prasy gracz używa strzelca pierścieniowego ze wskaźnikiem w kształcie ostrza miecza, aby celować i strzelać pociskami w rzędy, aby tworzyć i usuwać skupiska trzech lub więcej pasujących kulek.
Płytka dociskowa i kulki poruszają się powoli w dół ekranu. W rezultacie gracz nie musi się spieszyć, próbując wykonać to zadanie na kilku pierwszych poziomach. Musi jedynie precyzyjnie celować w bąbelkowe kule, co gra utrudnia, nie zapewniając linii celowania. Gracz może jednak kierować strzały pod kątem od ścian bocznych, aby trafić w trudno dostępne grupy połączonych, pasujących do siebie kulek.
Chociaż Bouncing Balls również nie zapewnia opcji wymiany pocisku, gracz otrzymuje podgląd następnego pocisku, aby pomóc mu szybciej zaplanować swoje strzały. Po wykonaniu uderzenia, które tworzy klaster, bąbelkowe kule w rzeczywistości nie odbijają się. Jedyne odbicie ma miejsce, gdy gracz odbije się od jednej z dwóch ścian bocznych. Zamiast tego kulki kurczą się, przekształcają w pomarańczowe gwiazdy, a następnie znikają z pola gry.
