Space Bubbles to strzelanka z bąbelkami o tematyce kosmicznej. Na tle nieba wypełnionego planetami na 70 poziomach gracz próbuje usunąć wszystkie bąbelki wiszące we wzorach, aby zdobyć punkty i odblokować nowe poziomy.
Gracz usuwa bąbelki z każdego pola gry, strzelając pociskami z działa statku rakietowego. Aby spróbować usunąć bąbelki za każdym strzałem, zamieniają główny pocisk z dodatkowym na pobliskiej platformie. Gdy uda im się trafić w skupisko dwóch lub więcej połączonych bąbelków, które pasują do pocisku, każdy bąbelek w skupisku kurczy się i znika. Wszelkie niepasujące bąbelki połączone z klastrem eksplodują w ognistych kolorach pomarańczowym, czerwonym i żółtym.
Space Bubbles utrudnia rozgrywkę, zmieniając pozycje bąbelków zwisających z poziomej platformy na szczycie pola. Platforma również powoli przesuwa bąbelki w dół ekranu. Każda bańka z połączonym wzorem, która osiągnie dno, powoduje przegraną gracza. Gra zapewnia również tylko krótką linię celowania wykonaną z blisko rozmieszczonych białych kropek, co oznacza, że gracz nie ma przedłużonej linii do dokładniejszego i bardziej precyzyjnego strzelania. Gracz może jednak wystrzelić niechciane pociski z dala od pola i w przestrzeń kosmiczną, strzelając w platformę, a nie w zwisające z niej bąbelki.
