Bubble Shooter Butterfly is een bubbel-knalpend spel met vlinderthema dat zich afspeelt in een prachtige buitenruimte die eruit ziet als een lente- of zomertafereel uit anime. Het doel van de speler is om een ringschieter te gebruiken om vlinders uit bubbels te bevrijden en punten te verdienen in honderden niveaus die in de loop van de tijd steeds uitdagender worden. Ze hebben toegang tot de niveaus door de vervolgoptie te gebruiken na het spelen van een niveau of door de pauzeknop te gebruiken om terug te keren naar de kaart op het startscherm.
De speler schiet projectielbellen naar de bubbels op het speelveld. Ze krijgen geen onbeperkt aantal, wat betekent dat ze elke slag moeten laten tellen. Ze gebruiken een laserrichtlijn met een helder ringvormig richtgereedschap om precisieschoten te maken. Ze moeten een projectiel afvuren op twee of meer bijpassende, gekoppelde bubbels om de lijn of groep te laten knappen. Als het secundaire projectiel een schot kan voltooien vóór het primaire projectiel, moeten ze de projectielen verwisselen door de schutter te selecteren.
Bubble Shooter Butterfly geeft de speler ook speciale projectielen om hem te helpen. Ze ontvangen bijvoorbeeld een Floral Beam-projectiel dat als een raket een lijn door de bellen snijdt. Bovendien bevatten sommige bubbels vuurvliegjes die willekeurig rond het veld vliegen en bubbels laten knappen nadat de speler ze heeft bevrijd.
Nadat de speler voldoende niveaus heeft voltooid, ontvangt hij schatkisten met munten en speciale projectielen. Ze ontvangen munten en maximaal drie sterren als ze een niveau winnen. Ze kunnen ook dagelijks een schatkist openen en aan een gelukswiel draaien om extra prijzen te verzamelen.
