Bubble Shooter: Farm Fruit é um jogo de rebentar bolhas com um jogo de salvamento de animais bebés. Num cenário desértico, o jogador ajuda uma galinha a salvar pintos presos em padrões de bolhas em 23 níveis padrão e um nível infinito. O jogador recebe uma pontuação, uma pontuação de bónus por manobras combinadas e projécteis não utilizados, e até três estrelas pelos seus esforços.
As bolhas claras contêm vários tipos de frutas inteiras, incluindo maçãs, cachos de uva, limões e melancias. Bolhas de gelo gelado, semelhantes a pedras, corações metálicos e outros objectos também estão frequentemente presentes em cada padrão.
O jogo carrega um padrão de baixo para cima do campo e, em seguida, tira grande parte dele de vista além do topo para dar ao jogador dicas sobre os locais de cada pintinho, a distribuição de bolhas com base na cor e tipo, e outros fatores importantes.
O jogador não usa um atirador nem pede à galinha para usar um. Em vez disso, pede-lhe que aceite as bolhas correspondentes de um cesto de vime cilíndrico, salte ligeiramente e atire cada uma para cima em direção ao padrão. Usa um ícone de seta dupla no cesto para trocar estes projécteis em qualquer altura.
Bubble Shooter: Farm Fruit ensina o jogador a pensar estrategicamente durante o jogo. Por exemplo, o jogador tem por vezes de visar uma linha horizontal ou outro tipo de grupo de frutos iguais, mais acima no padrão, perto de outras bolhas não iguais que caem como uma avalanche depois de o jogador atingir o alvo.