Sea Bubble Shooter es un juego de explotar burbujas. En una profunda ciudad submarina, el jugador explota burbujas que aparecen en patrones alrededor de un hexágono decorado con estrellas en el centro del campo de juego. El jugador elimina las burbujas disparando proyectiles a dos o más burbujas idénticas adyacentes. También pueden limpiar el campo de burbujas golpeando el hexágono con un solo proyectil.
Cuando el jugador dispara burbujas a un patrón alrededor del hexágono, todo el patrón gira. El jugador puede necesitar anticipar la dirección de la rotación. Pueden apuntar y disparar con más precisión utilizando una línea de puntería blanca extensible que tiran desde la zona de proyectiles situada debajo del campo de juego hasta una burbuja específica u otro punto. También pueden eliminar burbujas rápidamente usando cuatro potenciadores cerca de la esquina inferior derecha.
Si el jugador no consigue explotar burbujas un número determinado de veces, se forman nuevas burbujas y se expanden en espacios vacíos aleatorios dentro del patrón. También pierden la oportunidad de ganar todas las estrellas de logro con las que les premia el juego.
Sea Bubble Shooter sólo da las tres estrellas al jugador cuando lo hace extremadamente bien. También les recompensa con dinero. Una vez que adquieren un cierto número de estrellas, pueden desbloquear nuevos entornos de juego. Con la moneda pueden comprar potenciadores adicionales.
