Το Bubble Shooter Hexagon είναι ένα χρονομετρημένο παιχνίδι που ανοίγει φούσκες. Με φόντο μια θολή κοιλάδα λίμνης με ψηλούς, βραχώδεις βράχους και διάσπαρτα δέντρα το σούρουπο, ο παίκτης σκάει ομάδες από τρεις ή περισσότερες φυσαλίδες σε σχήμα εξαγώνου με στρογγυλές γωνίες, που μοιάζουν με γυαλιστερές καραμέλες με τεθλασμένα σχέδια. Πρέπει να καθαρίσει όλα τα πεδία του παιχνιδιού από αυτές τις εξαγωνικές φυσαλίδες σε 48 επίπεδα για να κερδίσει το υψηλότερο δυνατό σκορ επίτευξης.
Το παιχνίδι εμφανίζει τις φυσαλίδες σε κρεμαστά μοτίβα. Ο παίκτης πυροβολεί την κάθε μία χρησιμοποιώντας ένα μοναδικό σκοπευτή βελών σε στυλ σύρματος χωρίς γραμμή στόχευσης. Όταν δημιουργήσει επιτυχώς ένα σύμπλεγμα με ένα βλήμα φυσαλίδας και τουλάχιστον δύο συνδεδεμένες όμοιες εξάφθαλμες φυσαλίδες, το σύμπλεγμα συρρικνώνεται, σκάει σε πολλές μικρότερες όμοιες φυσαλίδες και στη συνέχεια πέφτει και εξαφανίζεται από το πεδίο.
Ο παίκτης αφαιρεί τις περισσότερες φυσαλίδες ταχύτερα πυροβολώντας σε μια οριζόντια σειρά ή σε μια συνδεδεμένη γραμμή με μοτίβο από πανομοιότυπες φυσαλίδες με μη ταιριαστές που συνδέονται με το σύμπλεγμα. Αν τελειώσει πριν τελειώσει ο χρόνος, λαμβάνει ένα μπόνους χρόνου 100 πόντων με βάση κάθε 10 δευτερόλεπτα. Για παράδειγμα, αν απομένουν 12 δευτερόλεπτα στο ρολόι, λαμβάνουν 120 πόντους.
Το Bubble Shooter Hexagon δυσκολεύει το παιχνίδι με παραδοσιακούς και μη παραδοσιακούς τρόπους. Ο παίκτης χάνει ένα επίπεδο αν αφήσει οποιαδήποτε φυσαλίδα να φτάσει στον πάτο του πεδίου ή αν ξεμείνει από χρόνο. Μπορεί να συνεχίσει μόνο με την αφαίρεση δύο σειρών φυσαλίδων ή την προσθήκη 30 δευτερολέπτων στο ρολόι, αν παρακολουθήσει διαφημίσεις. Το παιχνίδι δυσκολεύει επίσης τον παίκτη να δει τα πλευρικά τοιχώματα. Το χρώμα των κάθετων γραμμών αναμειγνύεται με το φόντο.
