Το Super Bubble Shooter είναι ένα παιχνίδι πυροβολισμού φυσαλίδων. Σε τέσσερα διασκεδαστικά σκηνικά που περιλαμβάνουν μια έρημο το σούρουπο, ένα δάσος στη ζούγκλα, ένα τρομακτικό νεκροταφείο τα μεσάνυχτα και ένα λιμάνι με ένα πειρατικό πλοίο, ο παίκτης ρίχνει βλήματα φυσαλίδων με δυνατότητα εναλλαγής από ένα κανόνι τύπου γλάστρας με διακεκομμένη γραμμή στόχευσης σε κρεμαστές σειρές συνδεδεμένων φυσαλίδων. Οι φυσαλίδες πάλλονται και εξαφανίζονται ή πέφτουν από την οθόνη όταν ο παίκτης δημιουργεί ομάδες τριών ή περισσότερων πανομοιότυπων φυσαλίδων. Για να κερδίσει την υψηλότερη δυνατή βαθμολογία, εκμεταλλευόμενος τους πόντους μπόνους που ανταμείβονται για κάθε περισσευούμενο βλήμα στο τέλος ενός επιπέδου, ο παίκτης πρέπει να εκτελέσει εργασίες με όσο το δυνατόν λιγότερα βλήματα.
Κάθε σκηνικό ή επεισόδιο προσφέρει 15 διασκεδαστικά επίπεδα με μοναδικά μοτίβα κρεμασμένων φυσαλίδων και προκλήσεις. Ο παίκτης χρησιμοποιεί τη διακεκομμένη γραμμή στόχευσής του για να εγγυηθεί τη σκοποβολή ακριβείας. Όταν ένα βλήμα δεν ταιριάζει με καμία προσβάσιμη φούσκα, μπορεί να επιλέξει τη μικρή δευτερεύουσα φούσκα στην κάτω αριστερή θέση κοντά στο κανόνι για να ανταλλάξει βλήματα. Εντοπίζουν τα υπόλοιπα βλήματά τους στην κάτω δεξιά θέση. Μπορούν να παρακολουθούν το σκορ τους ανά πάσα στιγμή κοιτάζοντας στην επάνω αριστερή γωνία. Το παιχνίδι τους παρέχει επίσης τρία αστέρια ως ανταμοιβή όταν τα πάνε καλά. Μπορούν να ελέγξουν αν βρίσκονται εντός στόχου για την επίτευξη αυτού του στόχου σε έναν κάθετο μετρητή μπάρας πλήρωσης στην αριστερή πλευρά.
Τα εμπόδια του Super Bubble Shooter περιλαμβάνουν φυσαλίδες τύχης που προσθέτουν και αφαιρούν βλήματα ή κινήσεις, ασπίδες που εμποδίζουν την έκρηξη ορισμένων φυσαλίδων σε μια ομάδα, φυσαλίδες με καρφιά που εκτοξεύουν βλήματα και πέτρες που δεν εκτοξεύονται ποτέ. Ο παίκτης συλλέγει και χρησιμοποιεί ισχυρά ενισχυτικά για να αντιμετωπίσει αυτές τις προκλήσεις, όπως βόμβες, αστραπές και ουράνια τόξα.
