Super Bubble Shooter es un juego de disparar burbujas. En cuatro entretenidos escenarios que incluyen un desierto al atardecer, un bosque selvático, un espeluznante cementerio a medianoche y un puerto con un barco pirata, el jugador dispara proyectiles de burbujas intercambiables desde un cañón estilo olla con una línea de puntería punteada a filas colgantes de burbujas conectadas. Las burbujas pulsan y desaparecen o caen de la pantalla cuando el jugador crea grupos de tres o más burbujas idénticas. Para obtener la máxima puntuación posible aprovechando los puntos de bonificación que se recompensan por cada proyectil sobrante al final de un nivel, el jugador debe realizar tareas con el menor número posible de proyectiles.
Cada escenario, o episodio, ofrece 15 divertidos niveles con patrones de burbujas colgantes y desafíos únicos. El jugador utiliza su línea de puntería punteada para garantizar la precisión del disparo. Cuando un proyectil no coincide con ninguna burbuja alcanzable, pueden seleccionar la pequeña burbuja secundaria en la posición inferior izquierda cerca del cañón para intercambiar proyectiles. Pueden seguir sus proyectiles restantes en la posición inferior derecha. Pueden seguir su puntuación en cualquier momento mirando hacia la esquina superior izquierda. El juego también les proporciona tres estrellas como recompensa cuando lo hacen bien. Pueden comprobar si están en el objetivo para alcanzar esa meta en un indicador de barra de llenado vertical en el lado izquierdo.
Los obstáculos de Super Bubble Shooter incluyen burbujas de azar que añaden y quitan proyectiles o movimientos, escudos que bloquean el estallido de algunas burbujas de un grupo, burbujas con pinchos que hacen estallar proyectiles y rocas que nunca estallan. El jugador recoge y utiliza potentes potenciadores para enfrentarse a estos retos, como bombas, rayos y arco iris.
