Bubble Shooter Challenge 2 - это игра-стрелялка, в которой пузырьки, похожие на конфеты, прыгают по темно-синему игровому полю, а затем лопаются в местах, отмеченных очками (например, 50, 100, 250, 100 и 50) в нижней части поля. Игрок пытается заработать как можно больше очков, чтобы занять место в глобальной таблице лидеров, стреляя снарядами из пузырьков, чтобы сбить скопления одинаковых пузырьков и все несовпадающие, прикрепленные к ним, с висящих рядов.
В игре есть подобранная по цвету пунктирная линия прицеливания с незаменяемым отдельным основным снарядом. В игре нет стрел, луков или пушек. Игрок использует линию для нацеливания совпадающих по цвету пузырьков, чтобы либо сбить кластер с ряда, либо запустить кластер, чтобы создать возможность для последующего разбивания пузырьков. Если игроку удается последовательно выбить кластеры из рядов, он получает увеличивающиеся множители, отображаемые в левой нижней части экрана.
В итоге Bubble Shooter Challenge 2 награждает игрока лазерным бустером, который прожигает линию разноцветных пузырьков благодаря этим последовательным удачным выстрелам. Если игроку не удастся остановить ряды, чтобы пузырьки не опустились на дно поля, игра закончится. Если игрок показывает достаточно высокие результаты, чтобы занять место в таблице лидеров среди 50 лучших игроков по всему миру, игра предлагает ему добавить туда свои данные.