Bubble Shooter Challenge 2 est un jeu de tir de bulles qui comprend des bulles de type bonbon qui rebondissent sur un terrain de jeu bleu foncé avant d`éclater sur des espaces marqués de points (50, 100, 250, 100 et 50) au bas du terrain. Le joueur tente de gagner autant de points que possible pour se classer dans un tableau de classement mondial en lançant des projectiles de bulles pour faire tomber les groupes de bulles correspondantes et toutes les bulles non correspondantes attachées à ces bulles des rangées suspendues.
Le jeu dispose d`une ligne de visée en pointillés de couleur assortie et d`un projectile principal autonome non interchangeable. Il n`y a pas de flèche, d`arc ou de canon. Le joueur utilise la ligne pour cibler des bulles de couleur assortie afin de faire tomber une grappe des rangées ou de commencer une grappe pour créer une opportunité ultérieure de faire éclater les bulles. S`il réussit à faire tomber des groupes de bulles de façon consécutive, il reçoit des multiplicateurs croissants affichés dans la zone en bas à gauche.
Bubble Shooter Challenge 2 récompense finalement le joueur avec un booster laser qui brûle une ligne de bulles de couleurs mélangées grâce à ces tirs consécutifs réussis. Si le joueur ne parvient pas à empêcher les rangées de faire glisser des bulles vers le bas du champ, le jeu se termine. Si le joueur est suffisamment performant pour figurer dans le classement des 50 meilleurs joueurs du monde, le jeu l`invite à y ajouter ses coordonnées.