Monkey Bubble Shooter es un juego de reventar burbujas al estilo rescate. Un mono necesita la ayuda del jugador para rescatar plátanos antropomórficos con diminutos brazos de palo que se agitan atascados dentro de burbujas que cuelgan en patrones en campos de juego a lo largo de 23 niveles regulares y un nivel infinito. El jugador gana puntos e intenta demostrar sus rápidas y eficientes habilidades para reventar burbujas consiguiendo todas las estrellas de logros disponibles en cada nivel.
En muchos juegos de explotar burbujas, el jugador utiliza una herramienta de disparo, como un arco y una flecha o un cañón. Los juegos de estilo rescate suelen contar con un personaje que actúa como tirador. El jugador dirige al personaje para que lance burbujas proyectiles, como pelotas, al aire hacia dos o más burbujas conectadas que coincidan para crear grupos de explosión automática.
En este juego, el jugador dirige al mono para que lance las burbujas a los puntos marcados con una línea de puntería extendida hecha de puntos blancos. Pueden hacer que lance el primer proyectil o darle un proyectil secundario cercano que flote sobre un tocón de árbol hueco. Realizan este intercambio seleccionando flechas en el tocón o utilizando una tecla del teclado del ordenador.
Monkey Bubble Shooter otorga al jugador puntos estándar por cada burbuja reventada. El jugador también recibe puntos extra por varios tipos de acciones estratégicas, como reventar racimos en una racha e incluso eliminar burbujas no coincidentes de un patrón reventando un racimo cercano.
El juego también proporciona puntos de bonificación cuando el jugador alcanza los plátanos con el menor número posible de proyectiles. Cada proyectil restante libera puntos de bonificación al final de un nivel. Todos los puntos aparecen cerca de la esquina superior izquierda junto a una barra vertical que muestra el progreso del jugador hacia la obtención de las tres estrellas de logro por nivel.
