Monkey Bubble Shooter is een bubbelspel in reddingsstijl. Een aap heeft de hulp van de speler nodig bij het redden van antropomorfe bananen met kleine zwaaiende armen die vastzitten in bubbels die in patronen op speelvelden in 23 gewone levels en een oneindig level hangen. De speler verdient punten en probeert te bewijzen dat hij snel en efficiënt bubbels kan knappen door alle beschikbare prestatiesterren in elk level te verdienen.
In veel bellenblaasspellen gebruikt de speler een schietgereedschap, zoals een pijl en boog of een kanon. Reddingsspellen hebben meestal een personage dat fungeert als schutter. De speler stuurt het personage de lucht in om projectiele bellen, zoals ballen, naar twee of meer bij elkaar horende bellen te gooien.
In dit spel geeft de speler de aap de opdracht om de bubbels naar plekken te gooien die zijn gemarkeerd met een verlengde miklijn van witte stippen. Je kunt hem het eerste projectiel laten gooien of hem een tweede nabijgelegen projectiel geven dat boven een uitgeholde boomstronk zweeft. Ze voeren deze verwisseling uit door pijlen op de boomstronk te selecteren of door een toets op het toetsenbord van de computer te gebruiken.
Monkey Bubble Shooter geeft de speler standaardpunten voor elke geknalde bel. De speler krijgt ook bonuspunten voor verschillende soorten strategische acties, zoals het laten knappen van clusters in een streep en zelfs het uit een patroon verwijderen van niet-matchende bubbels door een nabijgelegen cluster te laten knappen.
Het spel geeft ook bonuspunten als de speler de bananen bereikt met zo min mogelijk projectielen. Elk overgebleven projectiel levert aan het eind van een level bonuspunten op. Alle punten verschijnen in de linkerbovenhoek naast een verticale balk die de voortgang van de speler weergeeft op weg naar het verdienen van de drie prestatiesterren per level.
